研究藥物應用的新領域,為舊藥找出新活性

研究藥物應用的新領域,為舊藥找出新活性
科睿唯安
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Vladimir Poroikov 教授是莫斯科 Institute of Biomedical Chemistry 的教授,專長領域是基於配體的 (ligand-based) 電腦輔助藥物研發方法,並著重於開發及驗證的工作。Poroikov 教授也是全球率先將 科睿唯安 Cortellis Drug Discovery Intelligence  中的資料整合到運算方法的先行者。

他一開始使用平台,是為了搜尋特定生物活性藥物的相關資訊,並運用這些資訊建構質性的結構-活性關係 [(Q)SAR] 運算模型,確立化合物化學結構與其生物活性的關係,試圖研發具有特定藥效的分子結構,作為先導藥物使用。

 

「全方位的工具」

Poroikov 教授另一項研究重點是為老藥找出新的生物活性。他稱讚 Cortellis Drug Discovery Intelligence  是一款「全方位工具」。

Poroikov 表示:「若要開始研究新領域,我會先到 Cortellis Drug Discovery Intelligence 搜尋資料,初步瞭解該領域的大致狀況。」

Poroikov 表示,這些年來 Cortellis Drug Discovery Intelligence 資料庫收錄的生物和化學資訊不斷充實完善,他對於這項產品的使用程度也與日俱增;隨著 Cortellis Drug Discovery Intelligence  推出更加豐富的情報內容,再加上新型分析工具和精密的檢索功能,使他的研究受益良多。Poroikov 進一步說明:「我個人的研發成果,有助於更精確地瞭解一般的生化交互作用。」

 

愈趨精細的檢索

Poroikov 提到,隨著科學問題日漸複雜,他的檢索也愈來愈精細。他可以使用分子結構或次結構,來搜尋相關分子組的全方位資訊。隨著 Cortellis Drug Discovery Intelligence 新增更多欄位,有助於他更深入解釋各種生化反應。

他表示:「有時基於特定的需要,我會使用更精細的查詢,來縮小資訊檢索的結果範圍。」我們詢問 Poroikov,在他印象中哪一次使用 Cortellis Drug Discovery Intelligence 查詢的效果最好,他稍加思索後,提出了不同的看法:「我會根據特定研究興趣,使用許多不同的查詢,而它們都在特定案例中提供了最實用的結果。」

Poroikov 分享了一個案例:

「例如,我們在 2001 年針對兩百大藥品清單所列的八種新藥,發表其療效預測結果1 。我們預測,舍曲林 (Sertraline) 可運用在古柯鹼成癮的治療,氨氯地平 (Amlodipine) 可作為抗癌藥的增強劑,奧沙普秦 (Oxaprozin) 可作為介白質-1 的拮抗劑,而雷米普利 (Ramipril) 則具有抗風濕的作用。」

最近一份已發表的文獻分析指出,這些預測皆已經過實驗或臨床試驗的證實2-5

Poroikov 表示自己也曾經使用其他市售資料庫,但只有 Cortellis Drug Discovery Intelligence 具備他所謂「廣泛多元的資訊涵蓋範圍」,功能大幅超越其他競爭產品。Poroikov 與同事也曾嘗試公用研究資料庫等其他資源,但最終都會用回 Cortellis Drug Discovery Intelligence。他表示:「就人體用藥領域而言,我認為 Cortellis Drug Discovery Intelligence 提供更加精心編排的資訊。」

Poroikov 教授對於 Cortellis Drug Discovery Intelligence 特別讚賞之處,在於科睿唯安團隊長期提供的支援和指引,幫助他從 Cortellis Drug Discovery Intelligence 獲得最大效益。他表示,免費的網路培訓工作坊「讓他學到 Cortellis Drug Discovery Intelligence 最佳的資訊檢索方式」,而且公司的科學支援人員總能「迅速回答我的問題」。

身為忠實愛用者,Poroikov 將 Cortellis Drug Discovery Intelligence 推薦給俄羅斯和國外的許多科學家同僚。除了學術會議,他也利用這項工具,向俄羅斯國立醫學大學的研究所學生進行教學簡報。他不斷強調,Cortellis Drug Discovery Intelligence 是「在研究中人體用藥領域中,最可靠、多元的單一資訊來源」。

 

 

1. Poroikov V. et al. Top 200 Medicines: Can New Actions Be Discovered Through Computer-Aided Predictions? SAR and QSAR Environ Res, 2001, 12: 327-344

2. Mancino M.J. et al. Clinical Efficacy of Sertraline Alone and Augmented with Gabapentin in Recently Abstinent Cocaine-Dependent Patients with Depressive Symptoms. J Clin Psychopharmacol, 2014, 34: 234– 239

3. Takara K. et al. Differential Effects of Calcium Antagonists on ABCG2/BCRP-Mediated Drug Resistance and Transport in SN-38-Resistant
HeLa Cells. Mol Med Rep, 2012, 5: 603-609

4. Rainsford K.D. et al. Recent Pharmacodynamic and Pharmacokinetic Findings on Oxaprozin. Inflammopharmacology, 2002, 10: 185–239

5. Shi Q. et al. Ramipril Attenuates Lipid Peroxidation and Cardiac Fibrosis in an Experimental Model of Rheumatoid Arthritis. Arthritis Res Ther, 2012, 14: R223

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